Форум Apache

Можно ли дать какую-то директиву в htaccess, чтобы файл, допустим, 1.zip невозможно было скачать по внешней ссылке или прямому вводу в адресной строке браузера, а только по ссылке из 1.htm, который располагается на том же сервере и в той же директории?

Не, никак? :)

При желании любую защиту от файла можно обойти. Можно попробовать виртуальные одноразовые пути как на файлообменниках.